Академия Шинигами, расположенная в Городе Смерти. В её цетре живёт сама Смерть, по неким причинам, которые известны лишь узкому кругу людей, он не может покинуть данную Академию. В данном "учебном" заведении проводят совместное обучение Оружия Смерти и Повелителей.Первые — собственно, то самое оружие, которое позволит остановить гибель мира, вторые — это те, кто оружие будет держать в руках. Сам Синигами-сама отмечает их как «тусовку, защищающую мир», причём тут же добавляет: «Не втыкаю, правда, при чём тут Академия?» Дело в том, что студенты, изучаю не то, что им нужно в повседневной жизни, не географию, астрономию, литературу и многое другое, что является стандартом в обычных колледжах, школах. Основная их задача  — выполнять вывешенные на специальной доске задания, которые позволяют им собирать души "несостоявшихся" кишинов, ведьм и прочих злодеев.
Чем больше душа — тем сильнее воля личности. Некоторые души способны входить в резонанс, на время взаимно усиливая друг друга. В поединке с опасным и сильным противником, например таким как ведьма, резонансом часто пользуются Повелитель и его Оружие, чтобы во много раз повысить свою боевую эффективность. Впрочем, в неумелых руках резонанс не только бесполезен, но и опасен.

Итак...Наша история начинается через год, после нападения Кишина, после которого как не странно осталась в живых как Мизуне, так и Фр..что же до самого Асуры, то Шинигами-сама нашел способ, как запечатать его способности и жажду убийства. Сам же "бывший" кишин, теперь проживает в академии. Смерть тчательно контролирует его, чтобы в случии выхода его из под контроля, он не принёс вреда ученикам. Всё тихо и спокойно, всё как всегда...но слишком тихо...прямо как затишье перед бурей? Верно!
Ведьмы легли на дно и теперь их очень трудно обнаружить.
В параллельном мире, где влавствует и обитает кто угодно, кроме людей, медленно зараждается новое зло. Две сестры, две могущественные ведьмы. Банальная сора, из-за того, что не смогли поделить власть между собой. Вчера друзья, сегодня уже злейшие враги. Таким образом появились две новые группы ведьм, во главе которых эти самые сёстры. Вражду между собой, добиваясь каждая своей цели, они доставляют не мало проблем и самой академии.  Но "души, которые готовятся стать кишинами" тоже просто так время не теряли. Акидзава, тот кто поедает души в огромном количестве и с немыслемой скоростью, обладающей не малой силой, собирается стать кишином. Его цель-управление миром. А ведь ещё несколько лет назад никто и подумать не мог, что этот маленький мальчик способен на такое.
Итак..новое зло, состоящие "из трёх частей" - две ведьмы и одна проклятая душа. Новые проблемы, новые преключения. Кто кого?

Р.S. вскоре будет выставлена дополнительная, важная информация касаемая сюжета игры.